Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms