Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRHP20396 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRHP20396 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRHP20396 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRHP20396 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRHP20396 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRHP20396 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRHP20396 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRHP20396 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRHP20396 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
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