Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XBP1P17861 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XBP1P17861 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
XBP1P17861 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms