Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXD8P13378 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms