Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BMP3P12645 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BMP3P12645 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BMP3P12645 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms