Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RLBP1P12271 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RLBP1P12271 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms