Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DMDP11532 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DMDP11532 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DMDP11532 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DMDP11532 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DMDP11532 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DMDP11532 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DMDP11532 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms