Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRAPPC2P0DI81 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms