Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLBP06746 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
POLBP06746 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLBP06746 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLBP06746 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms