Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LDLRP01130 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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