Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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