Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APBB3O95704 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APBB3O95704 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APBB3O95704 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APBB3O95704 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APBB3O95704 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APBB3O95704 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APBB3O95704 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APBB3O95704 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APBB3O95704 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APBB3O95704 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APBB3O95704 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APBB3O95704 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms