Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC24AO95486 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms