Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTNBO60941 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DTNBO60941 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTNBO60941 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTNBO60941 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms