Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF14O43557 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF14O43557 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF14O43557 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF14O43557 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF14O43557 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF14O43557 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms