Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms