Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP17L12C9JPN9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms