Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRT4C9JH25 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms