Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HACD1B0YJ81 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms