Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GMNCA6NCL1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms