Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBA1A5PL33 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms