Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms