Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SRPRBQ9Y5M8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRPRBQ9Y5M8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms