Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1Q9Y3L3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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