Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEU3Q9UQ49 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEU3Q9UQ49 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms