Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB23Q9ULC3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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