Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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