Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CGGBP1Q9UFW8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms