Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
XCL2Q9UBD3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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