Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL13Q9P2N7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms