Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCDC88CQ9P219 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCDC88CQ9P219 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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