Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MKS1Q9NXB0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MKS1Q9NXB0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MKS1Q9NXB0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MKS1Q9NXB0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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