Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RAB9BQ9NP90 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms