Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SLIRPQ9GZT3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SLIRPQ9GZT3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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