Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFDQ9GZP0 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms