Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIPCQ9C0C6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms