Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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LRRC3Q9BY71 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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