Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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