Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UPK3BQ9BT76 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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