Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGIP1Q9BQI5 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms