Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LYSTQ99698 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms