Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SAMD8Q96LT4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SAMD8Q96LT4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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SAMD8Q96LT4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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