Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMARCE1Q969G3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms