Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
HLA-CQ95604 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-CQ95604 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms