Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3CQ92520 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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