Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms