Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE1Q8WV22 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms