Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T0

CPA6, Carboxypeptidase A6, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA6Q8N4T0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPA6Q8N4T0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPA6Q8N4T0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPA6Q8N4T0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPA6Q8N4T0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPA6Q8N4T0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPA6Q8N4T0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPA6Q8N4T0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CPA6Q8N4T0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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