Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCL2Q8N4E4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms