Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL3Q8IVW4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms